《仲景內科學》的編寫,是將兩書的原文,根據疾病的分類,分為傷寒溫病、時病、肺病、心病、肝膽病、脾胃病、腎膀胱病、血證、經絡病、外科病、婦人妊娠、產后、婦人雜病等疾病。在各類病證中,一般的是從疾病的證候屬性來分類的。至於《傷寒論》中的結胸、心下痞、蓄血、心煩、煙痛等證候,則分屬各類疾病中,不發球傷寒的范圍。另外根據兩書的方劑主治,結合實際應用,補充了頭痛、眩暈、胃脘痛、脅痛、瘀血、失眠、噎膈、反胃、腰痛、便秘等病,使運用經方治療內科疾病進一步完整起來。
本書的寫成,廢除了《金匱要略》、《傷寒論》的名稱,合編為《仲景內科學》,在保持《金匱要略》原書的基礎上,充實了《傷寒論》的證治方藥,尤其在應用部分,根據原方的主治,結合臨床實用,參考現代報道,重點地介紹了方劑的主治范圍,適應症狀,加減方法,目的在於實用。其內容比較豐富,是學習和運用經方治療內科及婦科疾病的重要參考書,為整理提高研究《傷寒論》與《金匱要略》開辟了新的途徑。