內容簡介

本書由該領域的國際知名專家撰寫,是第一本全面的化學基因組學專著,全面討論了化學基因組學的各個專題,以及從相關計算機芯片到實驗等的相關技術。第一部分描述了化學基因組學的定義和基本概念,包括從計算機芯片化學基因組學到基於芯片/微陣列等的主要技術。第二部分專注於特殊技術,討論了小分子探針研究特異基因產物方法的出現和應用實例。最后3章是藥物發現相關領域的研究實例,進一步強調了化學基因組學是多個研究方向相互關聯的綜合性研究方法,如脂質組學、神經遞質的藥學基因組學方向,以及DNA專利的近似線性配對算法。

本書可供藥物化學、分子生物學、生物信息學等專業科研人員參考,也可作為藥物化學專業教材使用。
 

目錄

前言
第1章 什麼是化學基因組學?
第2章 芯片上的化學基因組學
2.1 引言
2.2 將計算機技術應用到化學基因組學
2.2.1 蛋白質結構
2.2.2 蛋白質的同源模建
2.2.3 選擇適當的小分子
2.2.4 蛋白質功能的預測
2.3 案例研究
2.3.1 同源模型構建
2.3.2 基於蛋白質序列的方法
2.3.3 基於蛋白質結構的方法
參考文獻
第3章 化學基因組學過程的優化
3.1 引言
3.2 化學基因組學的化合物庫
3.2.1 化學基因組學化合物庫的設計
3.2.2 化合物質量
3.2.3 數據分析及整合
3.3 篩選進展:化學基因組學途徑
3.3.1 靶點的產生
3.3.2 分析平台
3.3.3 離子通道篩選的化學基因組學方法
3.3.4 確立設計一個持久有效的分析過程
3.3.5 重要的動力學因素
3.3.6 分析過程的穩定性以及驗證
3.3.7 小結
3.4 HTS技術及過程
3.4.1 選擇HTS平台
3.4.2 該途徑的量度(n個靶點×y個化合物)
3.4.3 假陽性和假陰性可接受的比率
3.4.4 合適的精密度和准確性
3.4.5 來自不同篩選階段的數據信息
3.4.6 HTS平台與化合物處理的整合
3.5 結論
致謝
參考文獻
第4章 化學基因組學中基於微芯片技術的高通量篩選
4.1 引言
4.2 微陣列
4.2.1 轉錄組學(transcriptomics):DNA陣列
4.2.2 化學基因組學:小分子陣列
4.2.3 蛋白質組學:大分子陣列
4.2.4 基於細胞的陣列:細胞組學方法
4.3 微流體
4.4 小結與展望
致謝
參考文獻
第5章 小分子在化學基因組學中的應用:有前景的高通量方法
5.1 引言
5.2 小分子在化學基因組學/蛋白質組學中:單一化合物方法與文庫方法
5.2.1 單個化合物作為探詢配體
5.2.2 化合物庫
5.3 庫的設計與選擇
5.3.1 化學基因組學中小分子探針的設計
5.3.2 基於組合片段的設計
5.3.3 動態配體自組裝
5.3.4 用於產生選擇性GPCR配體的多結合位點方法
5.3.5 用於設計篩選片段的Graffinity方法
5.3.6 基於片段的高通量結晶
5.3.7 ADME傾向性的設計:透膜小分子庫
5.4 復用與高通量技術
5.4.1 高通量基於細胞的檢測(細胞陣列)
5.4.2 反向雙雜交體系
5.4.3 平行親和柱分離
5.4.4 平行凝膠排阻色譜法(parallel size-exclusion chromatography):復雜混合物中快速親和選擇
5.4.5 化學微陣列
5.4.6 組合tehtering用液相平行合成
5.5 小結
致謝
參考文獻
第6章 用於快速蛋白質鑒定的多功能光探針
6.1 引言
6.2 主要光活性基團的化學性質
6.3 提高光親和標記通量的生物素化重氮甲烷
6.4 在固態基質上的光親和標記
參考文獻
第7章 定義脂質組:一個新的治療靶標
7.1 引言
7.2 治療學中主要的脂質組學靶標
7.2.1 磷酸肌醇
7.2.2 神經鞘脂類
7.2.3 溶血磷脂類
7.3 脂質組分析的方法
7.3.1 分析型脂質組學
7.3.2 功能性脂質組學
7.4 結語
參考文獻
第8章 多巴胺能神經遞質相關的基因多態性的藥物毒理學表現
8.1 多巴胺系統的概述
8.1.1 多巴胺的合成、功能和代謝
8.1.2 主要多巴胺能系統及與精神病理學的關聯
8.1.3 多巴胺系統的遺傳藥理學
8.2 鑒定基因多態性的方法
8.3 多巴胺受體
8.3.1 多態的多巴胺D2受體基因
8.3.2 多巴胺D2受體的遺傳藥理學
8.3.3 多巴胺D3受體基因的多態性
8.3.4 多巴胺D3受體基因的遺傳藥理學
8.3.5 高多態的多巴胺D4受體基因
8.3.6 多巴胺D4受體的遺傳藥理學
8.4 多巴胺轉運體
8.4.1 多巴胺轉運體及其變異體
8.4.2 多巴胺轉運體的遺傳藥理學
參考文獻
第9章 用於藥學產業中DNA專利申請評估的近似線性配對算法
9.1 引言
9.2 結果
9.3 結論
參考文獻
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