《流沙墜簡》按簡牘的內容和性質進行分類,析為三大類:第一大類是小學術數方技書,涉及《蒼頡》、《急就》、《力牧》、《歷譜》、《算術》、《陰陽》、《占術》、《相馬經》、《獸醫方》等多種典籍。第二大類是屯戍叢殘,其下又按內容分為簿書,烽燧,戍役,廩給,器物,雜事等六項。第三類是簡牘遺文,匯集各式書信。第一,三類由羅振玉完成,第二類是王國維撰作。此外,王國維選
作《補遺》,考釋斯坦因於尼雅河下游所獲晉初文書;又補《附錄》迻錄、考日本大谷探險隊橘瑞超於羅布淖爾北所獲前涼西域長史李柏書稿,另據斯坦因《塞林提亞——中亞和中國西域考古記》繪制敦煌鄣燧分布圖,並將各燧編號及其漢詩名稱、所出木簡列為一表。本書所錄包含了兩漢至魏晉間的木質、帛質及紙質文書,其中兩漢文書多木質,少量帛質,魏晉所出則木質、紙質並存。
為便利讀者,此次影又做了兩項工作:一是將原來的線裝八開本三冊縮影為精裝十六開本一冊;二是對原書統一另編頁碼,並新編目錄置於卷首。