禪宗典籍
四祖道信大師《入道安心要方便法門》校釋
真歇清了及其黑水城本《劫外錄》
附錄一︰重校本《劫外錄》
附錄二︰新校本《崇先真歇了禪師塔銘》
禪宗思想與歷史
如來藏與中印佛學的分歧
以梵語文獻為中心看禪的起源與流變
舍利信仰和僧傳——為了有助于理解《禪林僧寶傳》
傳世寶志禪偈考辨
唐五代湖南地區禪宗的興起
宗密“和會禪宗”再探
宋代禪宗史的特色——以宋代燈史的系譜為線索
“句雙紙”（禪林句集）與日本近代禪學
歐美禪學研究
《宇宙論與禪定︰從〈起世經〉到大乘佛學》
歐美禪學的寫作——一種方法論立場的分析
綜合研究
僧制建設的現代啟示
“儒家禪”初論——以韓貞為例
時間與分別
禪宗文學
晚唐時期中國禪宗南岳系的白話詩
現當代禪學
茶禪一味道平常——趙州大師“吃茶去”公案的現代闡釋
虛雲大師與七塔寺
呂澄與禪學研究
生活禪與天台宗的圓融觀
理事圓融生活禪
禪宗現代轉型之路剖析——以安祥禪、現代禪、生活禪為中心
禪本無言，何生三書——兼論吳言生《禪學三書》與當代禪學研究
古佛道場
唐以前的玉泉高僧
賀柏林禪寺萬佛樓落成佛像開光盛典
學術會議
“文化對話︰可能性與界限”國際學術研討會述評
“佛教與基督教對話”國際學術會議在西安召開
“玄奘大師與紫閣寺學術論證會”綜述
首屆吳越佛教文化研討會綜述
書序‧書評
《趙州錄校注集評》序（一）
《趙州錄校注集評》序（二）
《漢文佛教大藏經研究》
《中國佛教與唯識學》
《中國佛教散論》
《中國佛教與人文精神》
《佛教弘化的現代轉型》
《寒山詩注》
《听雨僧廬佛學雜集》
《台灣近代佛教的變革與反思》
《天台智者研究——兼論宗派佛教的興起》
《地藏信仰研究》
《入禪之門》
《何處青山不道場》
《星雲禪話》
《當代亞太地區宗教》
《和平的渴望——當代宗教對話理論》
《上帝之後》
《中國禪學》第一卷管窺——為了更有成效的學術交流
《中國禪學》稿約
《中國禪學》第一卷目錄
《中國禪學》第二卷目錄
