《分殊科學哲學史》分為上、下兩篇。上篇是以若干重要分支科學為反思對象的分支科學哲學史,所涉獵的分支史有:數學哲學史、物理學哲學史、生物學哲學史、系統科學哲學史、認知科學哲學史、社會科學哲學史;下篇是以一些特殊科學哲學問題為焦點的論爭和思想演變史,所選取的問題史有:主題與研究進路的轉換、科學精神與科學價值的歷史辨析、從哲學化的科學到可接受的科學、建構主義的科學哲學建構方式、另類科學哲學的興起與審度。
將哲學的反思立足於科學探究的現有結果,聚焦於具體的科學內容
大膽超越各種似是而非的哲學觀點上的對立
對科學的基礎和科學的實踐展開更加開放和更具啟發性的哲學反思