基因定位與育種設計

前言
第1章 遺傳研究群體
1.1 遺傳研究的常見群體類型
1.1.1 雙親群體
1.1.2 多親群體
1.1.3 創建遺傳群體的若干注意事項
1.2 基因型數據的初步整理和分析
1.2.1 基因型數據的獲取
1.2.2 基因頻率和基因型頻率
1.2.3 基因型頻率的適合性檢驗
l.3 基因效應和遺傳方差
1.3.1 群體均值和表型方差的計算
1.3.2 單基因座位上的加顯性遺傳模型
1.3.3 單基因座位上的遺傳方差
1.4 單環境表型觀測值的方差分析
1.4.1 表型值的線性分解
1.4.2 表型離差平方和的分解
1.4.3 水稻粒長性狀的單環境方差分析
1.5 多環境表型觀測值的方差分析
1.5.1 表型值的線性分解
1.5.2 表型離差平方和的分解
1.5.3 水稻粒長的多環境方差分析
1.6 基因型值和遺傳力的估計
1.6.1 單環境基因型值和遺傳力的估計
1.6.2 多環境基因型值和遺傳力的估計
1.6.3 異質誤差方差下基因型值的估計
練習題
第2章 連鎖分析和遺傳圖譜構建
2.1 世代轉移矩陣
2.1.1 世代轉移矩陣的定義
2.1.2 回交世代轉移矩陣
2.1.3 自交世代轉移矩陣
2.1.4 加倍單倍體世代轉移矩陣
2.1.5 連續自交的世代轉移矩陣
2.1.6 基因型理論頻率的矩陣表示
§2.2 兩個座位上各種基因型的理論頻率
2.2.1 10種基因型的理論頻率
2.2.2 永久群體中4種純合基因型的理論頻率
2.2.3 兩個共顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.4 一個共顯性和一個顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.5 一個共顯性和一個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.6 兩個顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.7 一個顯性和一個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.8 兩個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
§2.3 兩個標記／基因座位間重組率的估算一
2.3.1 DH群體中重組率的極大似然估計
2.3.2 重組率極大似然估計的一般形式
2.3.3 F2群體中一個共顯性座位和一個顯性座位間的重組率估計
2.3.4 Newton迭代算法中初始值的選取
2.3.5 F2群體中重組率估計的EM算法
2.3.6 奇異分離對重組率估計的影響
2.4 不同遺傳群體重組率估計的比較研究
2.4.1 不同遺傳群體中檢驗連鎖的LOD統計量
2.4.2 不同遺傳群體中重組率估計的准確度
2.4.3 不同遺傳群體檢測到顯著連鎖所需的樣本量
2.5 作圖函數和遺傳圖譜構建
2.5.1 遺傳干涉和干涉系數
2.5.2 作圖函數
2.5.3 標記分群算法
2.5.4 標記排序算法
2.6 隨機交配群體的連鎖分析
2.6.1 隨機交配與連鎖不平衡
2.6.2 基因型到配子的轉移矩陣
2.6.3 隨機交配若干代的配子型和基因型頻率
練習題
第3章 單標記分析和簡單區間作圖
3.1 單標記分析
3.1.1 單標記基因型均值的差異分析
……
第4章 完備區間作圖方法
第5章 互作QTL作圖
第6章 其他類型群體的基因定位
第7章 QTL作圖中的其他常見問題
第8章 育種過程的建模和模擬
第9章 育種方法的模擬和比較
第10章 育種中的預測和設計
參考文獻
中英文名詞對照和索引
圖版