全書分上、下篇,共19章。
上篇系統介紹了蛋白質的合成、轉運、加工與修飾、結構與功能,闡述了蛋白質分離純化,蛋白質定性、定量檢測的基本理論,以及蛋白質的生物信息學、蛋白質組學和蛋白質芯片理論與進展等;下篇介紹了蛋白質樣品的準備、蛋白質電泳技術、層析技術、蛋白質活性及定性和定量檢測的方法與應用,並在生物信息學預測蛋白質序列技術方面進行了實驗性闡述。
此外,對最近較為熱門的蛋白質組技術包括考馬斯亮藍染色、銀染色及質譜分析技術以及蛋白質定量檢測技術ELISA和Western blot進行了實例介紹。