生物計算︰生物序列的分析方法與應用

《數學與現代科學技術叢書》序
前言
第一部分 基本方法
第1章 生物序列突變與比對分析
1.1 生物序列突變與比對問題
1.1.1 生物序列的類型與結構
1.1.2 生物序列突變與比對問題的意義與應用
1.1.3 生物序列比對的原理與方法
1.2 二重序列比對的有關算法
1.2.1 關于動態規劃算法的一些說明
1.2.2 動態規劃算法
1.2.3 統計判決算法的基本思想
1.2.4 BLAST軟件的使用
1.3 多重序列的比對問題
1.3.1 MSA的意義與概況
1.3.2 MSA的定義與優化準則
1.4 MSA算法與計算
1.4.1 MSA算法的基本概念
1.4.2 MSA的算法步驟
1.4.3 ClustalW軟件的使用
1.4.4 關于MSA的幾點說明
1.4.5 幾個多重序列比對應用例子
1.5 SPA算法的原理與計算
1.5.1 SPA算法的基本原理
1.5.2 SPA算法的基本步驟
1.5.3 SPA算法源碼
1.5.4 SPA算法的有關問題討論
1.5.5 SPA算法的一個實例計算
習題與思考
第2章 系統發育分析
第3章 蛋白質一級結構的語義分析
第4章 蛋白質結構預測
第5章 基因識別
第6章 基因表達數據分析
第二部分 生物學備忘錄
第7章 核酸與DNA
第8章 氨基酸與蛋白質
第9章 基因與基因組
第10章 生物信息數據庫
第三部分 數學備忘錄
第11章 智能計算理論與算法
第12章 概率、信息與統計
第13章 隨機過程
第14章 有關圖與樹的基本知識
參考文獻
索引
《數學與現代科學技術叢書》已出版書目

當代數學在向縱深發展的同時，被空前廣泛地應用于幾乎一切領域．一方面，它與其他學科交匯，形成了許許多多交叉學科(例如，信息科學、計算機科學、系統科學、數學物理、數學化學、生物數學、數學語言學、數量經濟學、金融數學、復雜性科學、科學計算等)；另一方面，它又被應用于高新技術(如信息安全、信息傳輸、圖像處理、語音識別、網絡、海量數據處理、網頁搜索、遙測遙感、交通管理、醫療診斷、手術方案、藥物檢驗、商業廣告等方面)的開發，成為一些高新技術的核心．應用數學的這種發展趨勢急劇地擴展了數學的疆界，也深刻地改變了數學的面貌．

中國的經濟正在迅猛發展，其中的科技含量也與日俱增．為了提高自主創新能力，我國已經有不少數學工作者投身于這類應用數學的研究中，還有更多的數學工作者則正在密切關注這方面的進展，看好它的前景．愈來愈多的人希望了解這類應用數學的現狀，尋找入門之徑．

《數學與現代科學技術叢書》是力圖反映這個發展趨勢的一套應用數學叢書，它將較全面地向我國讀者介紹當今數學在現代科學技術各個領域中應用的狀況，通過必要的準備知識，逐步把讀者引向相關的研究前沿．

從事交叉學科研究和高新技術開發的應用數學家，除了要精通所需的數學知識外，還必須深入了解其所研究問題的來龍去脈．“建模”是應用數學研究實際問題的關鍵．這也是一門數學藝術︰從復雜的實際問題中抽象出關鍵的“量的關系”，它既能反映出問題的基本特征，又能用現階段的數學工具對其加以處理．有鑒于此，這套叢書的一個特點就是不但要介紹有關的數學理論和方法，還必須介紹問題的來源與背景、數學建模以及如何運用數學工具來解決實際問題．

本叢書適用于數學及相關專業的大學生和研究生，以及與數學有關的各專業科技工作者．