《靈素商兌》,靈,指《靈樞》;素,指《素問》。全書10個部分,2.6萬字,意在揭批《靈樞》、《素問》的謬誤之處,認為《內經》“無有一節可以為信”,為四千余年殺人之禍根,當殲滅之。首先,余雲岫指出,陰陽五行是《內經》理論的基礎,故書中通過證明陰陽學說之謬,說明《內經》在根本立足點上的錯誤;繼而通過當時西醫對人體解剖、生理、病因、病理的認識,證明中醫藏府經脈、六淫致病、切脈診病等理論的錯誤和荒謬。全書如此一路論證下來,當然如余雲岫所謂︰“此書一出,世之盲從荒唐、誕怪、迷信、二千年來術士薪傳之玄論者,可以喚醒其醉夢,恍然于舊說舊術之毫無根據,不可為訓,而贊成醫學革命之舉矣。”
《群經見智錄》方問世。全書約4.1萬字,分為3卷16個部分。該書意在正本清源,提出《內經》因為年代久遠而錯簡甚多,後世注家曲解、誤釋者亦不少,當用懷疑而非盲從的眼光去讀《內經》,方可推求和把握《內經》之精髓。惲鐵樵對《內經》發源、成書、讀法的論述,突破了長期以來盲目尊經的痼習,開拓了新的審視角度和研究方法;對易理、太極、五行的研究落實在四時陰陽變化上,使一直以來神秘而費解的理論變得通俗易懂。
1917年余雲岫著《靈素商兌》,用西醫的理論知識批判《內經》,該書的問世立即攪起了中醫存廢之爭的軒然大波,並由此開始了在中醫理論層面引人注目的爭辯。而惲鐵樵在深入研究和闡述了中醫理論體系自身,明了了《內經》根柢性的問題之後,對余雲岫的挑戰進行了正面回應。本書展現了《靈素商兌》與《群經見智錄》的原貌,以讓更多的讀者去了解它們,也為回應目前熱論的“中醫存廢之爭”提供了資料。